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Teilprojekt 11: Datenfluss und Analyse der Sequenzdaten, Bioinformatik Sanger & NGS Daten^GBOL: German Barcode of Life - Von der Wissenschaft zur Anwendung (GBOL-2)^Teilprojekt 12: Design und Implementierung von pilzspezifischen Microarrays ('EcoChips') für die Diagnostik^Teilprojekt 9: Pathogene und nekrotische Pilze in Obstbau und Forstwirtschaft, Referenzbibliothek und Phylochip^Teilprojekt 10: DNA-Metabarcoding von Makrozoobenthos im Rahmen der EU Wasserrahmenrichtlinie (WRRL), Teilprojekt 8: Koordination Projekt Pilze in Obstbau und Forstwirtschaft, Referenzbibliothek und Phylochip

Description: Der Verbund GBOL II wird weiter am Ausbau der ersten umfassenden 'DNA-Barcoding' - Gendatenbank der deutschen Flora und Fauna arbeiten. Vorhabensziel der Ruhr-Universität Bochum ist die 1) Erstellung einer umfassenden Inventarliste der Pilze in ausgewählten Habitaten mit eNGS, 2) Entwicklung eines einsatzbereiten DNA-Chips zur Diagnostik von Baumparasiten und Baum-assoziierten Arten sowie die 3) Komplettierung der Referenzdatenbank. Pilze übernehmen in allen terrestrischen Ökosystemen Schlüsselfunktionen und sind mit einer sehr großen Diversität in nahezu allen Habitaten vertreten. Dabei sind nicht nur wegen ihrer vielfältigen Ökosystemfunktionen für den Menschen von großer Bedeutung. Viele Sekundärstoffe und Enzyme aus Pilzen spielen in der modernen Biotechnologie eine wichtige Rolle. Darüber hinaus sind sie als Pathogene in der Medizin oder in der Land- und Forstwirtschaft oft die gefürchtetsten Organismen. Im Bereich der Pathogene ist jedoch eine genaue Identifizierung der Organismen essentiell und eine Grundvoraussetzung für eine erfolgreiche Bekämpfung. Die morphologische Bestimmung ist, in der Regel sehr zeitaufwändig und bisher ist nur ein Bruchteil der relevanten Arten mit einem Barcode charakterisiert. Im Projekt soll der Fokus vor allem auf den Baumparasitischen Arten liegen, da diese bisher besonders wenig untersucht wurden. In Deutschland und Mitteleuropa sind diese Gruppen vor allem für den Obstanbau und die Forstwirtschaft relevant. Im Rahmen des Projektes sollen zum einen die Datenbanken mit Vergleichssequenzen gefüllt werden, zum anderen soll jedoch auch ein DNA-Chip zur Diagnostik entwickelt werden. Darüber hinaus sollen mit Methoden des 'environmental Next Generation Sequencing (eNGS)' potentielle Pathogene identifiziert werden, lange bevor Symptome an den Bäumen zu sehen sind.

Types:
SupportProgram

Origins: /Bund/UBA/UFORDAT

Tags: Bochum ? Baumschaden ? Obstbau ? Pflanzengenetik ? Baum ? Morphologie ? Geobotanik ? Deutschland ? Mitteleuropa ? Forstschädling ? Habitat ? Ökologische Bestandsaufnahme ? DNA-Barcoding ? DNA-Analyse ? Analyseverfahren ? Terrestrisches Ökosystem ? Parasit ? Pilz ? Biotechnologie ? Flora ? Forstwirtschaft ? Krankheitserreger ? Arbeit ? Lebewesen ? Datenbank ? Datenerhebung ? Fauna ? Referenzwert ? Ökosystemfunktion ? Agrarschädling ? Diversität ? Früherkennung ? Sequenzierung ? environmental Next Generation Sequencing (eNGS) ? Genbank ? Krankheitsbild ? Enzym ?

Region: Nordrhein-Westfalen

Bounding boxes: 6.76339° .. 6.76339° x 51.21895° .. 51.21895°

License: cc-by-nc-nd/4.0

Language: Deutsch

Organisations

Time ranges: 2016-01-01 - 2018-12-31

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