Description: Paramecium ist ein ubiquitärer Einzeller, der in nahezu allen Arten von Frischwasserhabitaten vorkommt. Einige Paramecien besitzen den sogenannten Killer-Effekt: Killer-Paramecien geben toxische Partikel in das Medium ab, welche nach ihrer Aufnahme sensitive Paramecien töten. Diese Partikel sind Bakterien der Gattung Caedibacter, Endosymbionten der Killer Stämme. Caedibacter beherbergen eine ungewöhnliche Struktur, die R-Körper (refraktiler Körper) genannt wird. Ein R-Körper besteht aus einem Proteinband, dass von Rbv (R-Körper kodierender Virus) kodiert wird. R-Körper fungieren als Toxin-Transfersystem. Die Killer werden durch einen Resistenzmechanismus davor geschützt. Anscheinend werden alle drei Merkmale (R-Körper, Toxin, Resistenz) von Rbv kodiert. Somit ist diese Drei-Partner-Symbiose ein interessantes Beispiel für Phagen-abgeleitete Toxizität. Dieses Projekt beinhaltet die Charakterisierung der Rbv-Genome verschiedener Isolate und zielt darauf ab, deren Varianz mit der Phylogenie von Caedibacter und Paramecium zu korrelieren. Dadurch soll nicht nur die Evolution von dem ursprünglichen Rbv zu heutigen R-Körper codierenden Plasmiden sondern auch die Auswirkungen des Virus auf die bakterielle Wirtsspezifität nachvollzogen werden.
Types:
SupportProgram
Origins:
/Bund/UBA/UFORDAT
Tags:
Gewässerökologie
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Ingestion
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Resistenz
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Bakteriophagen
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Habitat
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Korrelationsanalyse
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Partikelemission
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Toxin
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Bakterien
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Evolution
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Symbiose
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Toxizität
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Virus
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Wirtsorganismus
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Phylogenese
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Partikel
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Protozoen
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Caedibacter
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Endosymbiont
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Genomanalyse
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Gentransfer
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Killer-Effekt
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Paramecium
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Plasmid
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R-body
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Ubiquität
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Region:
Saxony
Bounding boxes:
13.25° .. 13.25° x 51° .. 51°
License: cc-by-nc-nd/4.0
Language: Deutsch
Organisations
Time ranges:
2010-10-01 - 2014-02-28
Alternatives
-
Language: Englisch/English
Title: Co-evolution of Paramecium, its bacterial symbiont and the latter's phages: the Killer trait
Description: Paramecium is a ubiquitous unicellular organism found in almost all kinds of freshwater habitats. Some paramecia express the so-called killer trait: killer paramecia release toxic particles into the environment which kill sensitive paramecia after ingestion. These particles are bacteria belonging to the genus Caedibacter, endosymbionts of the killer strains. Caedibacter harbour an unusual structure termed R-body (refractile body). An R-body is a proteinaceous ribbon which is encoded by Rbv (R-body coding virus). R-bodies act as toxin delivery system. The killers are protected by a resistance mechanism. Apparently, all three features (R-body, toxin, resistance) are encoded by Rbv. Thus, this three-partner-symbiosis is an interesting example for phage-derived toxicity.rnrnThis project aims to characterize Rbv genomes from different isolates and correlate their variation with the phylogeny of Caedibacter and Paramecium. Thereby not only the evolution of ancestral Rbv to extant R-body coding plasmids can be reconstructed but also the viral impact on bacterial host range will be addressed.
https://ufordat.uba.de/UFORDAT/pages/PublicRedirect.aspx?TYP=PR&DSNR=1059615
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