Pflanzenbiotechnologie - Genomics-basierte Züchtung von Sonnenblumen für gesteigerten Ertrag, höhere Ertragsstabilität und verbesserte Züchtungseffizienz (SUNRISE), Teilprojekt C: Pflanzenbiotechnologie der Zukunft

Description: Vorhabensziel: SUNRISE zielt darauf ab, das Spektrum an ölproduzierenden Kulturpflanzen für europäische Märkte zu erweitern. Innerhalb des Projektes sollen Grundlagen für die genombasierte Züchtung als Voraussetzung für die langfristige Wettbewerbsfähigkeit von Sonnenblume gelegt werden. Zur Identifizierung von Resistenzgenen gegen den Falschen Mehltau (Plasmopara halstedii) werden innovative Züchtungsstrategien wie Hochdurchsatz-Sequenzierung und -Genotypisierung zur Anwendung kommen. Diese dienen der Charakterisierung und Klonierung des PlARG-Resistenzlocus auf Kopplungsgruppe 1. Eine detaillierte Haplotypenanalyse des Genortes wird die Marker-basierte Introgression dieser Resistenz in Elitematerial beschleunigen. Arbeitsplanung: Mithilfe einer F2-Kartierungspopulation soll der PlARG-Resistenzlocus auf Kopplungsgruppe 1 feinkartiert werden. Anhand von SSR-Markeranalysen werden rekombinante Linien identifiziert. Die Genotypisierung soll durch SNP- Detektion/Verifizierung erfolgen. Nach Phänotypisierung der F3-Generation und Kartierung werden Marker für MAS ausgewählt. Basierend auf vergleichender Sequenzanalyse zwischen einem anfälligen und einem resistenten bulk sowie dem resistenten Elter wird anhand ermittelter SNPs eine Vorhersage über Kandidatengene auf Kopplungsgruppe 1 getroffen. Für die Genomanalyse werden NGS-basierte Sequenzierungen durchgeführt.

SupportProgram

Origins: /Bund/UBA/UFORDAT

Tags: Introgression ? Genom ? Krankheitsresistenz ? Mutation ? Sonnenblume ? Genotyp ? Kartierung ? Kulturpflanze ? Ölpflanze ? Tracer ? Ernteertrag ? Gentechnik ? Mehltau ? Biotechnologie ? Pflanzenzüchtung ? Resistenzzüchtung ? DNA-Analyse ? Phänotyp ? Wettbewerbsfähigkeit ? Züchtung ? Effizienzsteigerung ? Ertragssteigerung ? Falscher Mehltau ? Genlokalisation ? Genomanalyse ? Klon ? Markergen ? Pflanzenerbgut ? Sequenzanalyse ? Sequenzierung ? Vermehrung ?

Region: Bayern

Bounding boxes: 12.53381° .. 12.53381° x 47.795° .. 47.795°

License: cc-by-nc-nd/4.0

Language: Deutsch

Organisations

• Bundesministerium für Forschung, Technologie und Raumfahrt (Geldgeber*in)
• KWS SAAT SE & Co. KGaA (Mitwirkende)
• Technische Universität München, Wissenschaftszentrum Weihenstephan für Ernährung, Landnutzung und Umwelt, Lehrstuhl für Pflanzenzüchtung (Betreiber*in)
• TraitGenetics GmbH (Mitwirkende)
• Umweltbundesamt (Bereitsteller*in)
• Universität Hohenheim, Landessaatzuchtanstalt (720) (Mitwirkende)
• Universität Hohenheim, Landessaatzuchtanstalt (720), Arbeitsgebiet Sonnenblumen und Leguminosen (Mitwirkende)

Time ranges: 2011-07-01 - 2015-03-31

Alternatives

• Language: Englisch/English
  Title: SUNRISE - Genomics assisted breeding in sunflower for better yield potential, stability and efficiency
  Description: Project goal: The project SUNRISE aims at broadening the spectrum of crops for oil production in European markets. Within the project fundamentals for genomics-assisted breeding are to be established as the ultimate prerequisite for long-term competitiveness of sunflower. To identify resistance genes against Plasmopara halstedii (Farlow) Berlese & de Toni, the causal agent of downy mildew in sunflower, innovative breeding strategies will be applied. High-throughput sequencing and genotyping are used for the characterization and cloning of the PlARG resistance locus on linkage group 1. The detailed haplotype analysis of the gene locus will accelerate the marker-assisted transfer of this resistance into elite breeding material. Working plan: Using a F2 mapping population, the PlARG resistance locus will be fine-mapped on linkage group 1. Recombinant F2 lines will be identified by SSR marker analysis and subsequently phenotyped in F2:3 which enables fine-mapping of the target region. A further genotyping of single nucleotide polymorphisms (SNPs) and their verification will increase the marker density and support a higher genetic resolution. A targeted sequencing approach based on the mutation mapping / SHOREmap approach will be pursued to obtain sequence information from phenotypic contrasting bulks (resistant and susceptible) as well as from the resistance donor as a reference. By means of identified SNPs between the bulks, a prediction of resistance gene candidates on linkage group 1 is made. https://ufordat.uba.de/UFORDAT/pages/PublicRedirect.aspx?TYP=PR&DSNR=1036177

Resources

• Webseite zum Förderprojekt

  https://www.tib.eu/de/filter/?repno=0315952C (Webseite)

Status

Aktiv

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