Description: Die Kopplung zwischen drei dominanten Gruppen von Bodenbakterien (Acidobacteria, Actinobacteria, Alphaproteobacteria), Pflanzen, Bodenbedingungen und Landnutzung soll aufgeklärt werden. Die Untersuchungen konzentrieren sich auf (1) die Dynamik der funktionellen Kopplung zwischen aktiven Rhizosphärenbakterien und Pflanzen, (2) die spezifischen Funktionen von individuellen Bakterien beim Abbau von Wurzelexsudaten, Pflanzenstreu und Tierkadavern/Dung sowie (3) der zeitlichen Stabilität von mikrobiellen Gemeinschaften in der Rhizosphäre und nicht-durchwurzeltem Boden der Exploratorien. Die funktionelle Koppelung der Bakterien über den Kohlenstofffluss soll zeitlich hochaufgelöst mittels 13C-Pulsmarkierung von Wurzelexsudaten durch Captured RNA Isotope Probing (CARIP), sowie durch den Vergleich der Exsudatprofile mit der Zusammensetzung der Bakteriengemeinschaften mittels Hochdurchsatzsequenzierung aufgeklärt werden. Die individuelle funktionelle Rolle der Bakterien wird anhand der Aufnahme 13C-markierter Substrate mit nachfolgender Identifizierung der aktiven Phylotypen durch Stabile Isotopenbeprobung von RNA (SIP) sowie metagenomische und metatranskriptomische Ansätze untersucht. Die kurzfristigen Veränderung in der Zusammensetzung der Rhizosphärenbakterien und die jeweiligen Einflussgrößen werden analysiert. Langfristigere Effekte werden anhand von Hochdurchsatzsequenzierungen von 3 Probensätzen, die einen Zeitraum von 6 Jahren abdecken, ermittelt. Dies bietet die Gelegenheit, langfristigere Trends mit Änderungen in den Umweltparametern und in der Landnutzung zu analysieren.
Types:
SupportProgram
Tags:
Wirtschaftsdünger
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Mikroökologie
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Substrat
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Actinobacteria
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Bodenbakterien
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Bodenmikroorganismen
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Landnutzungsänderung
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Rhizosphäre
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Bakterien
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Tierischer Abfall
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Bodenqualität
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Flächennutzung
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Kohlenstoffkreislauf
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Pflanzengesellschaft
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Pflanze
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Abdeckung
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Forschung
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Änderung
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Diversität
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Angewandte Mikrobiologie
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Isotop
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RNA
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Region:
Bremen
License: Creative Commons Namensnennung-keine Bearbeitung-Nichtkommerziell 4.0
Language: Deutsch
Organisations
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Deutsche Forschungsgemeinschaft (Finanzielle Förderung)
-
Umweltbundesamt (Bereitstellung)
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Universität Bremen, Fachbereich 02 - Biologie und Chemie, Arbeitsgruppe Mikrobielle Ökophysiologie (Projektverantwortung)
Last harvest: 29.09.2026 09:33
Time ranges:
2014-01-01 - 2026-09-29
Alternatives
-
Language: Englisch/English
Title: Sub project: Partitioning of Prokaryotic Functional Diversity under Different Land Use
Description: The aim of the project is to elucidate the coupling between major groups of soil bacteria (Acidobacteria, Actinobacteria, Alphaproteobacteria), plant communities, edaphic factors, as well as land use in the Exploratories. Investigations will focus on (1) the dynamics of functional coupling between active rhizosphere bacteria and plants, (2) specific functions of individual bacteria in the degradation of plant exudates, plant litter, and animal remains, as well as (3) the time dependent stability of rhizosphere and bulk soil microbial communities in the Exploratories. The functional coupling of individual bacterial species in organic carbon flux will be elucidated through time resolved 13C-stable isotope pulse labeling of root exudates using Captured RNA Isotope Probing (CARIP), and correlating the composition of exsudates with that of bacterial communities determined by high throughput sequencing. Individual functional roles of bacteria will be tested by the uptake of 13C-labelled substrates with subsequent identification of active phylotypes by stable isotope probing of RNA (SIP), and by metagenomics and metatranscriptomics. Intra-annual variability of these bacterial communities in response to land use shall be studied. Finally, long-term effects will be assessed across all 300 experimental plots by Illumina sequence analysis of three sample sets spanning 6 years, which provides the opportunity to elucidate long-term changes in bacterial communities and relating them to changes in environmental variables and land use.
URL: https://ufordat.uba.de/UFORDAT/pages/PublicRedirect.aspx?TYP=PR&DSNR=1084569
Resources
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