Description: In A22 werden wir mithilfe der Metagenomik untersuchen, wie die Mikrodiversität von Bakterien und Viren auf die Degradation von Fließgewässern unter dem Einfluss von mäßigen bis starken Stressoren (Fließgeschwindigkeit, Salz, Temperatur und Dürre) reagiert und wie sie sich nach einer Stressorenphase erholt. Wir nutzen die Daten aus ExStream-Experimenten (für alle vier Stressortypen in verschiedenen Kombinationen) und aus Freilanduntersuchungen (Dürre). Die Mikrodiversität wird sowohl anhand von Einzelnukleotidvarianten (SNVs) als auch von Strukturvarianten (SVs) analysiert.
Types:
SupportProgram
Origins:
/Bund/UBA/UFORDAT
Tags:
Natriumchlorid
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Mikroökologie
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Fließgewässer
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Sensor
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Salz
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Belastungsfaktor
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Dürre
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Bakterien
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Fließgeschwindigkeit
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Virus
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Süßwasserökosystem
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Angewandte Mikrobiologie
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Applied Microbiology
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Region:
Nordrhein-Westfalen
Bounding boxes:
6.76339° .. 6.76339° x 51.21895° .. 51.21895°
License: cc-by-nc-nd/4.0
Language: Deutsch
Organisations
-
Umweltbundesamt (Bereitstellung)
-
Universität Duisburg-Essen, Fachbereich Chemie, Forschungszentrum One Health, Abteilung Umweltmetagenomik (Projektverantwortung)
Time ranges:
2025-01-01 - 2025-10-02
Alternatives
-
Language: Englisch/English
Title: Sub project A22: Viral (and host) microdiversity response to multiple stressors in freshwater ecosystems
Description: In A22 we will use metagenomics to investigate how the microdiversity of bacteria and viruses responds to ecosystem degradation under the influence of moderate to severe stressors (flow velocity, salt, temperature and drought), and how it recovers after release from stressors. We will rely on data from highly parallelised ExStreamSIGMA experiments (for all four stressor types, in different combinations), or from field sites (for drought). The microdiversity will be evaluated based both on single nucleotide variants (SNVs) and on structural variants (SVs).
https://ufordat.uba.de/UFORDAT/pages/PublicRedirect.aspx?TYP=PR&DSNR=1138851
Resources
Status
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