Description: Terrestrische Grünalgen sind typische und häufige Komponenten biologischer Bodenkrusten der Polarregionen. Biologische Bodenkrusten bilden wasserstabile Aggregate und üben ökologisch wichtige Funktionen hinsichtlich Primärproduktion, Stickstofffixierung, Nährstoffkreislauf, Wasserretention und Bodenstabilisierung aus. Obwohl kaum Daten über Grünalgen in der Arktis und Antarktis vorliegen, wird ihre funktionelle Bedeutung als Ökosystem-Entwickler nährstoffarmer Gebiete als sehr hoch eingeschätzt. Die Biodiversität der Algen und Cyanobakterien polarer Bodenkrusten ist in den letzten Jahren zum ersten Mal von uns mit klassischen und molekularen Methoden (Metatranskriptomik und Metabarcoding) untersucht worden. In dem neuen Projekt wollen wir nun den physiologischen Zustand von Bodenkrusten der Antarktis aus Metatranskriptomen ermitteln. Dazu wollen wir die Sequenzen der Metatranskriptome einzelnen Arten (Gattungen, Familien oder anderen systematischen Kategorien) zuordnen und funktionell qualitativ und quantitativ untersuchen. Neben Datenbankvergleichen (KOG, KEGG, GO) können die spezifischen Submetatranskriptome auch mit den unter unterschiedlichen Laborbedingungen (Flüssigkultur/Agarplatten Kultur, Trockenstress, Temperaturstress, Lichtstress) gewonnenen Transkriptomen von Klebsormidium und sowie den in diesem Projekt geplanten neuen Transkriptomen je zweier antarktischer Klebsormidium und Coccomyxa Arten verglichen werden. Diese Daten werden erstmals einen molekularen Einblick in die Physiologie arktischen Arten in-situ im natürlichen Habitat zum Zeitpunkt der Probennahme und die Identifizierung von Schlüsselgenen für das Überleben in der Antarktis ermöglichen.
Types:
SupportProgram
Origins:
/Bund/UBA/UFORDAT
Tags:
Biopharmazeutikum
?
Cyanobakterien
?
Grünalgen
?
Nährstoff
?
Habitat
?
Mikroalgen
?
Stress
?
Antarktis
?
Arktis
?
Bestimmungsschlüssel
?
Daten
?
Nährstoffkreislauf
?
Stickstofffixierung
?
Trocknung
?
Vergleichsanalyse
?
Algen
?
Polargebiet
?
Spezies
?
Kryosphäre
?
Antarktisforschung
?
Datenbank
?
Ökosystem
?
Bodenverfestigung
?
Wasser
?
Biodiversität
?
Sequenzierung
?
Region:
Nordrhein-Westfalen
Bounding boxes:
6.76339° .. 6.76339° x 51.21895° .. 51.21895°
License: cc-by-nc-nd/4.0
Language: Deutsch
Organisations
Time ranges:
2020-01-01 - 2025-06-30
Alternatives
-
Language: Englisch/English
Title: Functional metatranscriptomics of Antarctic biological soil crust algae: Identification of key genes for the survival under the extreme conditions of Antarctica
Description: Terrestrial green algae are typical and abundant components of biological soil crusts (BSCs) in the Polar Regions. These communities form water-stable aggregates that have important ecological roles in primary production, nitrogen fixation, nutrient cycling, water retention and stabilization of soils. Although available data on green algae are generally very limited for the Arctic and Antarctica, their functional importance as ecosystem developers in nutrient poor environments is regarded as high. Recently, the biodiversity of algae and cyanobacteria has been determined by us for the first time using classical and molecular methods (Metatranscriptomics and Metabarcoding). In the new project, we want to use metatranscriptomes of Antarctic BSCs to determine the physiological status of the microalgae within the BSCs. To achieve this goal, we will assign the sequences within the metatranscriptomes to biological species (genera, families or other suitable categories). For functional analysis of the submetatranscriptomes we will compare (qualitatively and quantitatively) the sequences with several public databases (KOG; GEGG; GO) and the available transcriptomes. For further analysis, we will compare the submetatranscriptomes with transcriptomes obtained for cultures, of Antarctic Klebsormidium and Coccomyxa strains, under laboratory conditions (liquid culture/plate culture, desiccation, temperature stress and light stress). Several laboratory transcriptomes are available for Klebsormidium. For further comparison with the Arctic submetatranscriptomes we will establish transcriptomes in the laboratory from two additional Klebsormidium and two Coccomyxa strains isolated from the Arctic. The obtained data will allow for the first time to address the physiological status of polar algae in situ in their natural habitat at the time of sampling using molecular data. Furthermore, the comparison of the submetatranscriptomes for Klebsormidium and Coccomyxa will allow the identification of key genes for the survival within the Antarctic.
https://ufordat.uba.de/UFORDAT/pages/PublicRedirect.aspx?TYP=PR&DSNR=1118354
Status
Quality score
- Overall: 0.46
-
Findability: 0.50
- Title: 0.00
- Description: 0.03
- Identifier: false
- Keywords: 0.96
- Spatial: RegionIdentified (1.00)
- Temporal: true
-
Accessibility: 0.67
- Landing page: Specific (1.00)
- Direct access: false
- Publicly accessible: true
-
Interoperability: 0.00
- Open file format: false
- Media type: false
- Machine-readable metadata: false
- Machine-readable data: false
-
Reusability: 0.67
- License: ClearlySpecifiedAndFree (1.00)
- Contact info: false
- Publisher info: true
Accessed 1 times.