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Projekt: Diversitätsstudien und Ökosystemmonitoring an dem Modellstandort Gotlandtief, zentrale Ostsee^MIMAS: Die Rolle von Mikroorganismen im marinen Stoffkreislauf, Projekt: (Meta)transkriptomik an marinen Modellbakterien und Modellstandorten

Description: Das Projekt "Projekt: Diversitätsstudien und Ökosystemmonitoring an dem Modellstandort Gotlandtief, zentrale Ostsee^MIMAS: Die Rolle von Mikroorganismen im marinen Stoffkreislauf, Projekt: (Meta)transkriptomik an marinen Modellbakterien und Modellstandorten" wird/wurde gefördert durch: Bundesministerium für Bildung und Forschung. Es wird/wurde ausgeführt durch: Jacobs University Bremen gGmbH, School of Engineering and Science, Division Biology.1. Vorhabenziel Gegenstand des Verbundprojektes MIMAS ist die Entwicklung und Erprobung eines neuen Spektrums genombasierter Methoden, um die Stoffwechselleistung mariner mikrobieller Lebensgemeinschaften zu erfassen und wichtige metabolische Prozesse zu quantifizieren. Ziel ist ein vertieftes Verständnis der Rolle von Mikroorganismen in marinen Stoffkreisläufen. In diesem Vorhaben soll unter Verwendung der Pyrosequenzierungstechnik (tag-Sequenzierung) ein mRNA-basiertes Verfahren zur in situ-Erfassung der Genexpression entwickelt werden (Metatranskriptomik). Dadurch soll diese Sequenzierungstechnik als neues Werkzeug für die Umweltanalytik und Ökosystemforschung etabliert werden. 2. Arbeitsplanung Die Etablierung und Validierung der mRNA-tag Sequenzierung soll an Hand von Rein- und Mischkulturen gut charakterisierter und bereits vollständig sequenzierter, mariner Mikroorganismen vorgenommen werden, für die in zwei Fällen bereits DNA-Mikroarrays für Kreuzvergleiche zur Verfügung stehen. Anschließend soll das Verfahren an zwei ausgewählten Modellstandorten (Kabeltonne Helgoland, Gotlandtief) in situ zur Anwendung gebracht werden. Entscheidend ist dabei die Entwicklung von Techniken zur Extraktion, Aufbereitung und Konservierung mikrobieller mRNA. 3. Ergebnisverwertung Dieses Vorhaben trägt dazu bei, dass moderne genomische und molekulare Techniken in der nationalen marinen Ökosystemforschung verankert werden. Dadurch können in Zukunft die Folgen globaler klimatisch gesteuerter Veränderungen im Meeres- und Küstenbereich genauer erfasst und besser analysiert werden können. Damit werden auch die Grundlagen für wissensbasierte Klimaschutzmaßnahmen bereit gestellt. Ebenso ist ein verbessertes Verständnis anderer anthropogener Einwirkungen auf marine biogeochemische Stoffkreisläufe zu erwarten.

Types:
SupportProgram

Origin: /Bund/UBA/UFORDAT

Tags: Bremen ? Helgoland ? Extraktion ? Meeresorganismen ? Marines Ökosystem ? Prognose ? Bakterien ? Konservierung ? Meeresgewässer ? Analyseverfahren ? In-Situ-Verfahren ? Kohlenstoffkreislauf ? Stickstoffkreislauf ? Mikroorganismen ? Umweltanalytik ? Küstenregion ? Biologische Aktivität ? Ökosystemforschung ? Klimaschutz ? DNA-Analyse ? Klimafolgen ? Mischkultur ? Anthropogener Einfluss ? Aufbereitungstechnik ? Standortbedingung ? Stoffkreislauf ? Stoffwechsel ? Umweltveränderung ? Genexpression ? Genomanalyse ? Gotlandtief ? Metatranskriptomik ? Primärproduktion ? RNA ? Sequenzierung ? Genetischer Fingerabdruck ? Wassermikroorganismen ? mRNA-tag Sequenzierung ?

Region: Bremen

Bounding boxes: 8.83333° .. 8.83333° x 53.08333° .. 53.08333°

License: cc-by-nc-nd/4.0

Language: Deutsch

Organisations

Time ranges: 2008-10-01 - 2011-12-31

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