Charakterisierung des Genoms des europaeischen Steinobstvergilbungphytoplasmas durch Kartierung und zufallsmaessige Sequenzierung

Description: Das europaeische Steinobstvergilbung-Phytoplasma ist die wichtigste Ursache von Verfallserscheinungen bei den meisten Steinobstarten. Als erster Schritt zur genetischen Charakterisierung des Erregers soll zunaechst durch die Extraktion ganzer Genome aus befallenen Pflanzen, der Reinigung des Genoms durch Wechselfeld-Gelelektrophorese (PFGE) und anschliessendem Restriktionsverdau eine physikalische Kartierung vorgenommen werden. geeignete Fragmente sollen dann in kuenstlichen Bakterien-Chromosomen kloniert und in einem geeigneten Plasmid subkloniert werden. Genetische Informationen sollen dann durch das Ansequenzieren der in das Plasmid inserierten DNA-Fragmente erfolgen.

SupportProgram

Origins: /Bund/UBA/UFORDAT

Tags: Genom ? Genetik ? Kartierung ? DNA ? Extraktion ? Steinobst ? Pflanzenkrankheit ? Pflanze ? Europa ? Krankheitserreger ? Chromosomen ? DNA-Fragment ? Enzym ? Genlokalisation ? Genom-Extraktion ? Genomanalyse ? Klonierung ? PFGE ? Phytoplasma ? Plasmid ? Sequenzierung ? Steinobstvergilbung ? Wechselfeld-Gelelektrophorese ?

Region: Berlin Niedersachsen

Bounding boxes: 13.41377° .. 13.41377° x 52.5233° .. 52.5233°

License: cc-by-nc-nd/4.0

Language: Deutsch

Organisations

• Biologische Bundesanstalt für Land- und Forstwirtschaft (Betreiber*in)
• Kommission der Europäischen Gemeinschaften Brüssel (Geldgeber*in)
• Umweltbundesamt (Bereitsteller*in)

Time ranges: 1998-01-01 - 1999-12-31

Alternatives

• Language: Englisch/English
  Title: Characterisation of the Genome of the European Stone Fruit Yellow Phytoplasma by Restriction Mapping and Random Sequencing Approaches
  Description: The European stone fruit yellows phytoplasma is the most important cause of decline diseases of most stone fruit species. As the first step to gentically characterize the pathogen, it is planned to extract entire genoms from infected plants and purify them by pulsed field gel electrophoresis. Then, the genome will be digested with restriction enzymes, and suitable DNA fragments will be ligated into bacterial artificial chromosomes (BACs) and cloned in E. coli. The cloned macrofragments will be subcloned in a plasmid vector. Initial genetic information will be obtained by sequencing the distal parts of the cloned fragments. https://ufordat.uba.de/UFORDAT/pages/PublicRedirect.aspx?TYP=PR&DSNR=68951

Status

Aktiv

Quality score

• Overall: 0.44
• Findability: 0.42

  • Title: 0.00
  • Description: 0.07
  • Identifier: false
  • Keywords: 0.43
  • Spatial: RegionIdentified (1.00)
  • Temporal: true
• Accessibility: 0.67

  • Landing page: Specific (1.00)
  • Direct access: false
  • Publicly accessible: true
• Interoperability: 0.00

  • Open file format: false
  • Media type: false
  • Machine-readable metadata: false
  • Machine-readable data: false
• Reusability: 0.67

  • License: ClearlySpecifiedAndFree (1.00)
  • Contact info: false
  • Publisher info: true

Accessed 1 times.