Description: Das Projekt "Alcanivorax - Funktionsanalyse des Alcanivorax borkumensis SK2 Genoms (GenoMik)" wird/wurde gefördert durch: Kommission der Europäischen Gemeinschaften Brüssel. Es wird/wurde ausgeführt durch: Gesellschaft für Biotechnologische Forschung mbH.Ziel des Vorhabens ist es, durch die Analyse der kompletten Genomsequenz von A. borkumensis ein detailliertes Verständnis der metabolischen Eigenschaften, sowie deren Regulation unter umweltrelevanten Bedingungen (u.a. Salinität, Oligotrophie) zu erlangen. Die Genomsequenzierung erfolgt mittels 'shot-gun' Sequenzierungsverfahren. Für die anschließende Arbeiten zum 'Lückenschließen' und 'Sequenzverifizierung' wird eine BAC-Bibliothek erstellt. Nach der Sequenz-Annotation erfolgt die in silico-Analyse der Phänotyp-Genotyp-Beziehung von A. borkumensis und die metabolische Modellierung der zentralen Stoffwechselwege. Parallel werden Transposonmutanten hergestellt und charakterisiert, um die aufgestellten Arbeitshypothesen zu validieren. Mit den Arbeiten zur Proteom und Transkriptom-Analyse von A. borkumensis wird begonnen. Die Ergebnisse der Untersuchungen zum Stoffwechsel von Alcanivorax dienen der Entwicklung von neuen Bioremediationsverfahren, insbesondere von Inokulations- und Bioaugmentationsverfahren. Darüber hinaus kann die Genomsequenz für die Entwicklung von Biosensoren zur Detektion des Verschmutzungsgrad mit Erdölkontaminationen eingesetzt werden.
SupportProgram
Origin: /Bund/UBA/UFORDAT
Tags: Genom ? Alicyclischer Kohlenwasserstoff ? Brüssel ? Biosensor ? Biochemie ? Europäische Gemeinschaften ? Gentechnik ? Meeresorganismen ? Oligotrophie ? Bakterien ? Biotechnologie ? Schadstoffabbau ? Wirkungsanalyse ? Mikroorganismen ? Modellierung ? Bioremediation ? Stoffwechsel ? Alcanivorax-borkumensis ? Genomanalyse ?
Region: Niedersachsen
License: cc-by-nc-nd/4.0
Language: Deutsch
Time ranges: 2004-06-01 - 2006-05-31
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