Description: Das Projekt "Entwicklung eines standardisierten Verfahrens zum begleitenden Monitoring von Auswirkungen von transgenen Kulturpflanzen auf die mikrobielle Rhizosphaerengemeinschaft" wird vom Umweltbundesamt gefördert und von Fraunhofer-Institut für Molekularbiologie und Angewandte Oekologie durchgeführt. *Im vorliegenden Forschungsprojekt wurde ein standardisiertes Verfahren zur Beschreibung der Auswirkung gentechnisch veränderter Pflanzen auf die mikrobielle Rhizosphärengemeinschaft entwickelt. Dabei kamen folgende Methoden zum Einsatz: Dot-Blot Hybridisierungen, die Erstellung von bakteriellen und pilzlichen Klonbibliotheken sowie DNA-Mikroarrays. Parallel wurde am Institut für Statistik der RWTH-Aachen ein vorläufiges Computerprogramm zur Auswertung und Interpretation der gewonnenen Daten entwickelt. Die anfangs benutzte Dot-Blot-Methode stellte sich als wenig reproduzierbar heraus, weshalb im weiteren Verlauf des Projektes der Schwerpunkt auf die Anwendung der DNA Mikroarray-Technologie gelegt wurde, die aufgrund ihrer methodischen Auslegung ohnehin besser für die Untersuchung größerer Probenmengen geeignet ist. Im Laufe des Projektes wurden bakterielle und pilzliche Klonbibliotheken erstellt und fortlaufend erweitert, um einen genaueren Einblick in die Zusammensetzung der Rhizosphäre der Raps- bzw. Maispflanzen zu bekommen. Die gefundenen Häufigkeiten der bekannten Bakterientypen korrelierte mit den per Dot-Blot-Hybridisierung ermittelten Verteilungen. Ca. 25 Prozent der gefundenen Bakteriensequenzen und 75 Prozent der gefundenen pilzlichen Sequenzen konnten phylogenetisch nicht eingeordnet werden und repräsentieren bis heute unbeschriebene Organismen. Die DNA-Mikroarray-Methode wurde für die vorliegende Anwendung adaptiert und optimiert. Nach der Erstellung von Slides mit allen 97 zu der Zeit zur Verfügung stehenden phylogenetischen Sonden zur Einordnung von Bodenorganismen wurde ein eigens angebautes Testfeld beprobt und die Proben mit Hilfe der DNA Mikroarray-Technologie analysiert. Die Daten wurden statistisch ausgewertet und auf verschiedene Einflussfaktoren untersucht. 8 - 10 der untersuchten Sonden zeigten relevante Expressionsunterschiede für den Einflussfaktor transgen - nicht transgen. Das beschriebene Verfahren (inkl. Auswerteprogramm) zum großflächigen anbaubegleitenden Monitoring transgener Pflanzen ist den derzeitig vorhandenen Techniken überlegen (PCR-unabhängig; effizienter Probendurchsatz; Bearbeitung hoher Probenmengen) und ist daher unserer Einschätzung nach von großer wirtschaftlicher und wissenschaftlicher Bedeutung. Sollte ein großflächiger Anbau transgener Pflanzen in den nächsten Jahren erfolgen, könnte das Verfahren durch verschiedene Untersuchungsbehörden auf seine Anwendbarkeit in der Praxis intensiv evaluiert und falls nötig, den entsprechenden Anforderungen angepasst werden, was im Sinne des Verwertungsplans ist. Ferner konnten weitere pilzliche SSU rRNA Gene identifiziert werden, die das Spektrum an bekannten Mikroorganismen der Rhizosphäre von Pflanzen deutlich erweitern und bei zukünftigen Analysen der vorliegenden mikrobiellen Lebensgemeinschaft berücksichtigt werden müssen.
SupportProgram
Origin: /Bund/UBA/UFORDAT
Tags: Gen ? Genom ? Mais ? Biologische Wirkung ? Mikrobiologie ? Molekularbiologie ? Gentechnisch veränderte Pflanze ? Bodenmikroorganismen ? Extraktion ? Nukleinsäure ? Nutzpflanze ? Pflanzenbestand ? Rhizosphäre ? Software ? Statistische Daten ? Bewertungsverfahren ? Bodenorganismen ? Datenverarbeitung ? Gentechnisch veränderte Organismen ? Mikroelektronik ? Monitoring ? Standardmethode ? Statistische Analyse ? Stichprobe ? Wirkungsanalyse ? Mikroorganismen ? Pflanze ? Forschungsprojekt ? Hybridisierung ? Probenahme ? Planung ? Informationsgewinnung ? Datenerhebung ? Hybridisierung [Nukleinsäure] ? Sonde ? Auswertungsverfahren ? rRNA-Gensonde ? Messgenauigkeit ? Mikrochip ? SSU ?
Region: Nordrhein-Westfalen
Bounding boxes: 6.76339° .. 6.76339° x 51.21895° .. 51.21895°
License: cc-by-nc-nd/4.0
Language: Deutsch
Time ranges: 2001-01-01 - 2005-12-31
Webseite zum Förderprojekt
https://www.tib.eu/de/filter/?repno=0312324 (Webseite)Accessed 1 times.