ERA-NET EUPHRESCO II: Methoden zum Nachweis von Erwinia amylovora zur phytosanitären Diagnose, raschen vor-Ort Analyse und epidemiologischen Erfassung (PHYTFIRE)

Description: Drei Bst DNA Polymerasen wurden im Einsatz bei der Blue EaLAMP getestet, wobei die neueren Bst DNA Polymerasen (Bst 2.0 und Bst 2.0 WarmStart) keinen Vorteil brachten. Diverse chemische Substanzen in den Proben für die Blue EaLAMP können diese stören, was jedoch nur jene Proben betrifft, die aus konventioneller Probensammlung (Blütenwaschwasser) stammen. Dieses Problem wird durch das Bienen-Monitoring umgangen. Die Blue EaLAMP-Reaktionsgefäße können bis zur Verwendung über einen langen Zeitraum (bisher 43 Tage getestet) bei -20 C gelagert werden. Dieser Zeitraum umspannt zumindest die Kernobstblütezeit. Im Jahr 2012 wurden an 3 Standorten in Österreich und an einem Standort in der Schweiz Untersuchungen zum Vorkommen des Feuerbranderregers Erwinia amylovora in Erwerbsobstbaugebieten durchgeführt. Während der Kernobstblüte erfolgten dabei parallel ein Bienen- und Blütenmonitoring, um qualitative und quantitative Informationen über ein mögliches Vorkommen von E. amylovora im Flugkreis der Bienen, bzw. in den beprobten Erwerbsobstanlagen, zu erhalten. Die zum Erregervorkommen gewonnenen Daten aus dem Bienen- und Blütenmonitoring wurden im Nachhinein mit jenen aus einem Feuerbrand-Prognosesystem (MaryblytTM) in Beziehung gesetzt. Pro Versuchsstandort kamen 2 - 5 Bienenvölker zum Einsatz. An diesen waren am Flugloch je 2 Röhrenkollektoren mit Folien pro Volk montiert, um die Feuerbranderreger zu erfassen. Die Betreuung der Völker, der Wechsel der Kollektorröhren und die Sammlung der Blütenproben erfolgten durch die Imker bzw. Obstbauern vor Ort einmal pro Tag. Der qualitative und quantitative Nachweis von E. amylovora erfolgte mittels qPCR. Die Praxistests mit Röhrenkollektoren verliefen ohne Probleme für die Bienenvölker. Die unterschiedlichen Beutentypen und Aufstellungsarten der Bienenvölker erforderten Anpassungen bei der Montage der Versuchseinrichtungen. Sowohl mit dem getesteten System eines bienengestützten Monitorings als auch mit der Untersuchung der parallel gezogenen Blütenproben war es möglich, E. amylovora im Sammelgebiet der Bienenvölker bzw. den beprobten Obstanlagen nachzuweisen. Zwischen Völkern, Probenahmeterminen und Folien bzw. Blütenproben zeigten sich Unterschiede im qualitativen und quantitativen Ergebnis des E. amylovora-Nachweises. Daraus leitet sich die Notwendigkeit ab, zumindest mehrere Monitoringvölker pro Standort einzusetzen bzw. eine repräsentative Anzahl von Blütenproben in der zu untersuchenden Obstanlage zu ziehen. usw.

SupportProgram

Origins: /Bund/UBA/UFORDAT

Tags: Biene ? Fluoreszenz ? Imkerei ? Obstbau ? Zierpflanze ? Obstwiese ? Schweiz ? Österreich ? Blüte ? Datierung ? DNA ? Mehltau ? On-Site-Verfahren ? Prognose ? Chemikalien ? Epidemiologie ? Messdaten ? Messverfahren ? Monitoring ? Pflanzenkrankheit ? Protein ? Qualitative Analyse ? Quantitative Analyse ? Mikroorganismen ? Standortbewertung ? Wertermittlung ? Krankheitserreger ? Informationsgewinnung ? Probenahme ? Datenerhebung ? Speicherung ? Chemischer Stoff ? Enzym ? Nassreinigung ? PFEIL15: Nachhaltige landwirtschaftliche Produktionssysteme ? Bepflanzung ? Feuerbrand ? Genetischer Fingerabdruck ?

License: cc-by-nc-nd/4.0

Language: Deutsch

Organisations

• Bundesministerium für Land- und Forstwirtschaft, Umwelt und Wasserwirtschaft Österreich (Geldgeber*in)
• Höhere Bundeslehr- und Forschungsanstalt für Landwirtschaft Raumberg-Gumpenstein (HBLA) (Mitwirkende)
• Umweltbundesamt (Bereitsteller*in)
• Universität für Bodenkultur Wien, Abteilung für Biochemie (Betreiber*in)

Time ranges: 2012-10-04 - 2014-10-31

Alternatives

• Language: Englisch/English
  Title: ERA-NET EUPHRESCO II: Phytosanitary diagnostic, on-site detection and epidemiology tools for Erwinia amylovora (PHYTFIRE)
  Description: Three Bst DNA polymerases were tested for the Blue EaLAMP, but the newer Bst DNA polymerases (Bst 2.0 and Bst 2.0 WarmStart) showed no better performance. Several chemicals were tested if they could interfere with the Blue EaLAMP when conventional sampling methods (collection of blossoms and subsequent washing; =flower-monitoring) are used. This problem is circumvented by the intended use of the bee-monitoring system. The Blue EaLAMP reaction tubes can be stored at -20 C over a long period (43 days are tested to date) which spans the time of pome fruit blooming. In the year 2012, on three locations in Austria and one in Switzerland, bee- and flower-monitoring was done in commercial orchards, to gain qualitative and quantitative information about the abundance of Erwinia amylovora during bloom. Afterwards, data were set in relation to the results of the prognosis model MaryblytTM. 2-5 beehives were used at every location and were sampled once a day. Detection of E. amylovora was done with qPCR. Both, bee- and flower-monitoring showed, that E. amylovora was present in the orchards. However, qualitative and quantitative differences were found between beehives, sampling dates, collector foils and flower samples. Therefore, more than one beehive (or a representative amount of flower samples) for each location would be meaningful. At the three Austrian locations no fire blight symptoms were found after bloom, despite E. amylovora was detected sporadically at low titres there. Therefore, the E. amylovora titre and occurrence of fire blight symptoms could not be correlated in this case. In Switzerland both, bee- and flower-monitoring methods detected E. amylovora in the orchard (significantly higher titres than in the Austrian locations), and also fire blight symptoms occurred after bloom. A first, but only vague correlation of the bacterial titre and the occurrence of fire blight symptoms can be made with this single finding. For the reliable integration of the method into fire blight prognosis models and the determination of a threshold value (bacterial titre at which fire blight symptoms occur), additional experiments over several years at different locations with various bacterial titres are necessary. Moreover, protein fingerprinting methods (MALDI-TOF) (Gehring et al. 2011, Wensing et al. 2012, Rezzonico et al.) should be optimized to gain insight into the composition and interaction of microorganisms (pathogens and antagonists) on flowers of host plants. This should improve fire blight prognosis models as well as risk assessments for protection strategies. For the monitoring, a protocol for the screening of routine samples from orchards via MALDI-TOF will be established. Results will be verified by PCR and qPCR. https://ufordat.uba.de/UFORDAT/pages/PublicRedirect.aspx?TYP=PR&DSNR=1046503

Resources

• Webseite zum Förderprojekt

  http://www.euphresco.org/ (Webseite)

Status

Aktiv

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