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Dissolved organic matter (DOM) dynamics obtained through ultra-high resolution mass spectrometry (FT-ICR-MS) in the anoxic basin Mariager Fjord, Gotland Basin, and Black Sea

We studied dissolved organic matter (DOM) dynamics in the anoxic basin Mariager Fjord, Gotland Basin, and Black Sea. Therefore, we performed a mass spectrometric analysis of DOM extracts via FT-ICR MS on a 15 Tesla solariX XR Fourier-transform ion cyclotron resonance mass spectrometer (Bruker Daltonik GmbH, Bremen, Germany). The system was equipped with an electrospray ionization source (ESI, Bruker Apollo II) applied in negative ionization mode. Methanol extracts were mixed with ultrapure water (50:50 v/v) for FT-ICR MS analysis and diluted to a final DOC concentration of 2.5 mg C/L. 200 single scans with an ion accumulation time of 0.1 s were recorded over a mass range of m/z 100 to 1,000 Da and added to one spectrum. Data processing, molecular formula assignments, and compound category classifications were done with the software pipeline ICBM-OCEAN. All sample data was normalized to the intensity sum of 1. FT-ICR-MS data from Mariager Fjord (Denmark), Gotland Basin (Baltic Sea), Black Sea, and an abiotic (de)oxygenation experiment are provided. The data consists of the molecular formula with corresponding m/z measured at an FT-ICR-MS and relative intensities for each sample of these molecular formulas. Additionally, we included common molecular parameters, including H/C, O/C and S/C ratios for each molecular formula.

WMS SL GDI Oberflächenmodelle - DOM Shaded Relief (2016)

Oberflächenmodelle Saarland:Ein DOM ist ein Digitales Höhenmodell, das im freien Gelände dem DGM entspricht, also die natürliche Geländeoberfläche abbildet, ansonsten aber über die Oberflächen der Gebäude und der beständigen Vegetation verläuft. Datengrundlage sind die durch Laserscanning gewonnen dreidimensionalen Messpunkte. DOM bilden die Situation zum Zeitpunkt der Erfassung ab. Bedingt durch unterschiedliche Erfassungszeitpunkte können z.B. bei Vegetations- und Wasserflächen Höhensprünge auftreten. Hohe schmale Objekte wie bspw. Windräder und Strommasten können nur bedingt abgebildet werden.

Fernerkundung - Höhenmodelle Hamburg

In der <b> Fernerkundung - Höhenmodelle</b> werden Höhendaten der Freien Hansestadt Hamburg als hochwertige Geodaten bereitgestellt. Unterschiede in den Höhenmodellen: Kategorisch wird zwischen <b>Geländemodellen und Oberflächenmodellen </b> unterschieden. - Geländemodelle: Abbildung des direkten Erdbodens ohne Höhen-Objekte (Gebäude, Baumbestände, etc.). - Oberflächenmodelle: Abbildung der Erdoberfläche inklusive Höhen-Objekte (Gebäude, Baumbestände, etc.). Auf freier Fläche stimmen das Geländemodell und Oberflächenmodell bei gleichem Zeitpunkt überein. Wie wird die Höhe gemessen? Zum Einsatz kommen unterschiedliche Aufnahmesysteme (<b>Drohne, Flugzeug, Satellit</b>) mit unterschiedlicher Sensorik (Laserscanning, Radar-, Multispektral-Sensorik). Jede Kombination bringt verschiedene Vor- und Nachteile mit sich, was sich in der räumlichen Auflösung, zeitlichen Auflösung (Aktualität) und den Nutzungsbedingungen widerspiegelt. Sind die Unterschiede nachteilig? Keinesfalls! Die Vielfalt ermöglicht es erst, eine Vielzahl an Anwendungsbereichen abzudecken. Somit gibt es für jeden Anwendungsfall einen geeigneten Datensatz. Die Höhendaten unterstützen bei der Dokumentation von Veränderungen (#Change Detection), der städtischen Planung sowie des Monitorings von Umweltentwicklungen und Infrastruktur. Sie können sowohl als Datengrundlage für KI-Trainingsdaten als auch zur direkten Betrachtung der urbanen Landschaft genutzt werden. Unser Ziel ist es, die hochwertigen Daten nicht nur Fachleuten, sondern auch der Öffentlichkeit zugänglich zu machen – leicht verständlich und nutzerfreundlich (#Geoportal Hamburg). <b> &#8594; Ein Blick in die Daten lohnt sich.</b>

DOMWSV - Digitale Oberflächenmodelle (DOMWSV00)

Digitale Oberflächenmodelle (DOM) beschreiben neben der nätürlichen Geländeform auch die Oberfläche aller auf der Erdoberfläche befindlichen Objekte durch die räumlichen Koordinaten einer repräsentativen Menge von unregelmäßig angeordneten Oberflächenpunkten. Die DOM-Daten liegen im XYZ-Datenformat (ASCII) vor und sind blockweise im Blattschnitt der Deutschen Grundkarte 1:5.000 zusammengefaßt. Sie haben eine Kachelgröße von 2 km x 2 km. Die geometrische Genauigkeit liegt bei +/- 0,25 m in der Lage (XY) und +/- 0,10m in der Höhe (Z). Das Datenvolumen der XYZ-Datei (ASCII) beträgt abhängig von der Punktdichte (DOM-00) zwischen 1-80 MB pro Block.

Environmental data from anoxic basins in the Mariager Fjord in Denmark, the Gotland Basin in the Baltic Sea, and the Black Sea

We studied dissolved organic matter (DOM) dynamics in the anoxic basin Mariager Fjord, Gotland Basin, and Black Sea. In this data set we provide environmental data (oxygen, salinity, temperature), dissolved and solid-phase extracted carbon (DOC, SPE-DOC), nitrogen (TDN, SPE-DON), sulfur (SPE-DOS), and phosphorus (SPE-DOP) concentrations. Elemental analysis of carbon and nitrogen were carried out with a High-temperature catalytic combustion, Shimadzu, Shimadzu TOC-VCPH equipped with TDN unit, analysis of extractable sulfur and phosphorus with Inductively coupled plasma optical emission spectroscopy, Thermo Fisher Scientific GmbH, iCAP PRO.

Geländemodelle Hamburg - DGM

Aus Laserscanvermessungen (Airborne Laserscanning) abgeleitetes, flächendeckendes digitales Geländemodell mit einer Rasterweite von 1 Meter für die Fläche der Freien und Hansestadt Hamburg. Die Daten stammen jeweils aus den landesweiten 3D-Laserscanbefliegungen aus 2010, 2020 und 2022. Eine punktuelle Aktualisierung dieser Daten erfolgt über photogrammetrische Produkte und ist ggf. in den Metadaten der einzelnen Jahrgänge dokumentiert. Die Genauigkeit eines einzelnen Messpunktes liegt in eindeutig definierten Bereichen, wie z. B. auf Straßenflächen, bei ca. ± 15 cm. In Bereichen von Abschattungen (z. B.: Brücken), dichter Vegetation, insbesondere Flächen in Wald- und Strauchgebieten und bei stark geneigtem Gelände, ist die Genauigkeit geringer. Neben der reinen Bereitstellung der Höheninformation als regelmäßiges Gitter werden die Daten auch als Dienstleistung in einer Dreiecksvermaschung (TIN) abgegeben. Dabei ist ein Datenaustausch mit 2D- und 3D-CAD-Systemen sichergestellt. Als weitere Dienstleistung können z.B. Höhenlinien und Profile abgeleitet oder Volumina und Neigungen errechnet werden. Durch Integration weiterer Geobasis- und Fachdaten (Vektor- und Rasterdaten) können weitere Dienstleistungen z.B. für die Bereiche Wasserwirtschaft, Tiefbau, Umwelt und Stadtplanung sowie Energieversorgung für groß- und kleinräumige Anwendungen abgeleitet werden.

Molecular DOM composition (relative peak intensities) obtained through ultra-high resolution mass spectrometry (FT-ICR-MS)

Here we present the dissolved organic matter (DOM) data of the sea surface microlayer (SML) and underlying water (ULW) during a multidisciplinary mesocosm study at the Sea sURface Facility (SURF) of the Institute for Chemistry and Biology of the Marine Environment (ICBM) in Wilhelmshaven, Germany (53.5148 °N, 8.1463 °E). The study was conducted from 18 May to 16 June 2023. Water samples were collected using a glass plate for the SML and a tube at a depth of 40 cm. DOM was extracted and desalinated by solid-phase extraction as described by Dittmar et al. (2008). The extracts were stored frozen in methanol until analysis. Aliquots were mixed with 50% ultrapure water (50:50 v/v) and diluted to a final carbon concentration of 2.5 ppm. DOM composition was analysed using a SolariX XR FT-ICR-MS (Bruker Daltonik GmbH, Bremen, Germany) with a 15 Tesla superconducting magnet and an electrospray ionisation source (ESI; Bruker Apollo II ion source) in negative ion mode. Data processing and molecular formula assignment were performed in ICBM-OCEAN, as described by Merder et al. (2020).

Digitales Oberflächenmodell (bDOM20)

Das bildbasierte DOM (bDOM) bildet die Erdoberfläche und die darauf befindlichen Objekte zum Zeitpunkt der Aufnahme der Luftbilder ab. Bildbasierende DOM sind regelmäßig strukturierte Punktwolken, die mittels Korrelation orientierter Luftbilder (OLB) aus dem geotopographischen Bildflug generiert werden. Dieses Verfahren bietet die Möglichkeit, Koordinatenpaare pixelweise zuzuordnen und mit Attributen wie z. B. den Farbwerten der Luftbilder (RGBI) zu versehen. Ein weiteres Attribut beschreibt, ob der Höhenwert eines Rasterelementes aus der Bildkorrelation berechnet oder interpoliert wurde und damit ein synthetisch erzeugter Punkt ist. -Dieser Datensatz steht ausschließlich bei online-Abruf kostenfrei zur Verfügung.-

Dissolved organic matter composition in the sea surface microlayer during a Mesocosm study in Wilhelmshaven, Germany (FT-ICR-MS and ATR-FTIR), spring 2023

We studied dissolved organic matter (DOM) dynamics in the sea surface microlayer (SML) during a mesocosm study at the Sea sURface Facility (SURF) of the Institute for Chemistry and Biology of the Marine Environment (ICBM) in Wilhelmshaven, Germany (53.5148 °N, 8.1463 °E). The study was conducted from 18 May to 16 June 2023 as part of the multidisciplinary BASS research unit (Biogeochemical processes and Air-sea exchange in the Sea-Surface microlayer). SURF was filled with pretreated natural seawater from the nearby Jade Bay (53° 28' 42'' N, 8° 12' 15'' E) to replicate natural conditions. We selected this approach to examine the regrowth of surviving phytoplankton cells after the initial water treatments, simulating a native microbial community starting with almost no bioproduction or pre-existing bioproduction products. To induce and maintain the phytoplankton bloom, inorganic nitrogen, phosphorus, and silicate were added on May 26, May 31, and June 01, 2023. By that, we induced an algal bloom of Emiliania huxleyi and Cylindrotheca closterium. Water samples were collected using a glass plate for the SML and a tube at 40 cm depth for the underlying water (ULW). This dataset contains DOM molecular data from ultrahigh-resolution mass spectrometry (Fourier-transform ion cyclotron resonance mass spectrometer, FT-ICR-MS), molecular indices calculated from FT-ICR-MS data (Ibio, Iphoto, IDEG) and environmental data, including dissolved organic carbon (DOC) and dissolved organic nitrogen (DON). Furthermore, it contains attenuated total reflectance Fourier Transform Infrared (ATR-FTIR) data from representative samples for each bloom phase. By combining molecular analyses with nutrient and bloom-phase data, we highlight the in situ production of carbohydrate-like and laminarin-derived DOM as a significant contributor to SML composition. General metadata from the multidisciplinary mesocosm study, including temperature, salinity and chlorophyll a, are provided in Bibi et al. on PANGAEA at the following link: doi:10.1594/PANGAEA.984101.

Molecular and elemental composition of dissolved organic matter in anoxic basins (Mariager Fjord, Denmark; Gotland Basin, Baltic Sea; Black Sea)

The sampling campaigns were conducted in the Black Sea (POS539), Baltic Sea/Gotland Basin (EMB324), and on a boat in Denmark/Mariager Fjord. All three study sites are differently influenced by ocean deoxygenation and anoxia. While Mariager Fjord waters are seasonally anoxic, the deep waters of Gotland Basin and Black Sea can remain anoxic for decades and millennia, respectively. Furthermore, to target potential abiotic reactions, we incubated filtered Gotland Basin waters at low (<1.5µM O2) and high (>200µM O2) oxygen concentrations. All samples were filtered to 0.2 µm pore size and acidified with hydrochloric acid to pH2. DOM was extracted and desalted prior to molecular analysis with ultrahigh resolution mass spectrometry (FT-ICR-MS) following an established method using cartridges filled with a styrene-divinylbenzene copolymer (Agilent Bond Elut PPL, 1 g). This data set contains two files: (1) environmental data, including oxygen concentrations, salinity, temperature, dissolved and solid-phase extractable dissolved carbon (DOC, SPE-DOC), nitrogen (TDN, SPE-DON), sulfur (SPE-DOS), and phosphorus (SPE-DOP), and (2) processed FT-ICR-MS data for all samples.

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