Ziel des Vorhabens ist es, ein besseres Verständnis der Aktivitäten von mikrobiellen Gemeinschaften und deren Interaktionen unter realen Umweltbedingungen zu erlangen. Ein solches Verständnis ist nicht nur für einen Einsatz von Mikroorganismen zu Zwecken der Bioremediation und als das Pflanzenwachstum unterstützende Wirkstoffe notwendig, sondern auch für die Entwicklung von Strategien zur Bekämpfung potentiell pathogener Mikroorganismen, da nur bei Vorhandensein entsprechender Kenntnisse zielgerichtet in natürliche komplexe Systeme eingegriffen werden kann. Dieses weitreichende Verständnis soll durch die direkte Sequenzierung von mRNA und hierdurch die Analyse des Transkriptoms von Repräsentanten der Stämme Cupriavidus pinatubonensis (Bioremediation), Burkholderia phytofirmans (das Pflanzenwachstum unterstützend) und Staphylococcus aureus (nokosomiales Pathogen) in Modellsystemen und des Metatranskriptoms in natürlichen Umweltproben (Bodenproben, humane Proben), in denen diese Organismen vorhanden sind und das Erstellen funktionaler Netzwerke erreicht werden. Arbeitspaket 1, Monat 1-12: Optimierung und Standardisierung von Protokollen zur mRNA Extraktion aus verschiedenen Umwelten. Arbeitspaket 2, Monat 1-12: Transkriptomanalyse in Modellsystemen. Arbeitspaket 3, Monat 9-24: Metatranskriptomische Überblicke über mikrobielle Gemeinschaften in Umweltproben. Arbeitspaket 4, Monat 9-24: Rekonstruktion funktionaler Netzwerke.
Es soll nachgewiesen werden, ob Staphylococcus aureus in vivo eine Mikropolysaccharidkapsel bildet. In vitro sollen Faktoren nachgewiesen werden, welche die Bildung der Mikropolysaccharidkapsel regulieren koennten. Anhand eines Tiermodells soll nachgewiesen werden, welche Faktoren die Bildung der Mikropolysaccharidkapsel in vivo regulieren.
Die im Vorhaben bearbeitenden Fragestellungen lassen sich drei Themenkomplexen zuordnen: In Teil 1 werden die schon lange interessierenden Fragen des Vergleichs der Desinfektionsmittelresistenz bakterieller Tierseuchenerreger mit der der Pruefkeime, wie sie die Deutsche Veterinaermedizinsche Gesellschaft (DVG) fuer die Desinfektionsmittelpruefung vorschreibt, sowie nach dem Abschneiden der Grundwirkstoffe (Grobdesinfektionsmittel) in einer Desinfektionsmittelpruefung gemaess den Richtlinien der DVG bearbeitet. Teil 2 eroertert die Fragestellung, ob die Bildung mikrobieller Aerosole bei der Reinigung und Desinfektion mit dem Hochdruckreiniger durch das Vorweichen der zu reinigenden und zu desinfizierenden Flaeche mit desinfektionsmittelhaltigen Loesungen verringert oder vermieden werden kann. In Teil 3 wird die Wirksamkeit von Desinfektionswassen bzw Desinfektionsmatten bei der Stiefeldesinfektion und die Wirksamkeit von Durchfahrbecken bei der Desinfektion von Fahrzeugreifen anhand zweier Testkeime ueberprueft. Anschliessend werden zum Vergleich Versuche durchgefuehrt, bei denen die Stiefel zusaetzlich mit einer Buerste in der Desinfektionsmittelloesung gereinigt werden. Bei der Fahrzeugreifendesinfektion werden als Alternative zum Durchfahrbecken ein Hochdruckreinigungs- und Desinfektionsverfahren und eine automatische Reifenwaschanlage getestet.